《空军军医大学学报》杂志是由空军军医大学主管、空军军医大学教研保障中心主办的高级综合性医药卫生类学术期刊，月刊，A4开本，ISSN 2097-1656，CN 61-1526/R，邮发代号52-86。主编为张思兵校长。《空军军医大学学报》经历了《第四军医大学学报》（1980—2009）和《医学争鸣》（2010—2021）两个发展阶段。期刊以“反映国内外基础医学、临床医学、军事医学等方面的前沿性研究成果，传播医学领域新理论、新成果、新技术、新方法、新经验”为办刊宗旨，报道国内外医学科研成果，特别是军事医学科研成果。

学报曾获首届中国期刊奖（1999年），解放军期刊奖荣誉奖（2000年），第二届国家期刊奖提名奖（2003年），百种杰出学术期刊（2005—2008年），中国精品科技期刊（2008年），新中国60年有影响力的期刊（2009年），RCCSE中国核心学术期刊（A）（2011年、2013年），陕西省特色科技期刊（2012年），中国高校特色科技期刊（2012年、2014年），陕西省精品科技期刊（2014年），陕西省高校优秀期刊奖（2016年），第四届陕西省科技期刊精品奖（2016年），中国高校优秀科技期刊奖（2016年），中国高校编辑出版质量优秀科技期刊（2018年），陕西省优秀科技期刊奖（2018年），第七届陕西省科技期刊优秀期刊奖（2023年），陕西省科技期刊编辑学会工作突出贡献单位奖（2023年）。

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